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智人身上的尼安德特人基因纵然不多，但价值不低。进一步研究表明，这些基因有利于人体对蛋白质的吸收，而蛋白质的吸收有利于人体抵御寒冷。尼安德特人长期在欧洲进化，比来自非洲的智人更加适应寒冷的气候，智人在欧洲和中亚与尼安德特人混血后，在选择保留和抛弃哪些基因时，更多保留了适合寒冷气候的基因。[16]

令人意想不到的是，含尼安德特人基因最多的是东亚人，而不是尼安德特人故乡的欧洲人。造成这一差异的原因可能是，早期智人进入东亚后，人群相对稳定，早年获得的尼安德特人基因也一直较好地保存了下来，而欧洲在农业革命开始后，经历了1万年前农民的移民潮和最近几千年来游牧群体的移民潮，稀释了早年欧洲智人的基因组合。[17]

基因测试的结果说明，智人和尼安德特人之间有混血，但程度很低，不足以证明全面融合论。从基因角度来说，尼安德特人基本已被灭绝，他们少量的基因搭上智人的车保留了下来。[18]

智人携带的少量尼安德特人基因也未必是“融合”的证据。更有可能的是，智人在暴力入侵时，夺人土地的同时也抢走他们的妇女，从而留下了这些基因证据。也就是说，即使残存的尼安德特人基因也可能是暴力而非融合的证据。与融合论相比，暴力论更符合逻辑，更符合尼安德特人被智人灭绝的大背景，更能让人信服。

我们总要提醒自己，很多事情，即使科学也很难提供完全可靠的结论。现代智人身上尼安德特人的基因很少，这虽然让人对融合理论持怀疑态度，但还不能完全否认这一理论。还有一种可能是，基因差异影响出生率，不育的概率是基因差距的平方。智人和尼安德特人之间的基因差异虽然没有大到产生生殖隔离，但也足以导致他们的混血后代不育或低生育率的可能性增加。这样，出生率的差异在一个漫长的时间过程中，导致尼安德特人基因的稀释

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