这场不对等的战争眼看就要以荷兰胜利结束，但就在这时，许多炮弹突然从天而降。原来，位于澳门的耶稣会神学院代理负责人布鲁诺在荷兰人进攻之前，将四门大炮卸下，拉到神学院所在的山上重新架好。神学院的修士（包括去过中国的罗雅谷和汤若望）指挥炮手向山下的荷兰人开炮。其中一发炮弹正好打中位于入侵部队中间的一个火药库，荷军大乱。葡萄牙人反攻，将荷兰人赶回了大海，许多人在逃跑时死去。
这场战争本身规模不大，影响却相当深远。首先，广东地方政府之前的策略一直是不让澳门堡垒化，但在这次进攻之后，广东政府选择站在葡萄牙人一边，为了保卫澳门的安全，只得让它堡垒化。澳门防御能力的增强，又让它具备了更加独立的地位。