沈的做法也得到了南京秀才们的支持，他们联名上书请求清理天主教。
除了普通的对传教士传教行为的控告之外，沈㴶还特别提到传教士有意冲掉明太祖陵的龙脉，并提醒皇帝，天主教徒有可能不会对皇帝忠诚。
作为帝国的南部都城，不可能所有官员都喜欢传教士的做派。沈㴶担任南京礼部侍郎之后，于万历四十四年（1616）5月上奏，以“陪京都会不宜令异教处此”的理由请求清理天主教。见《明史·沈㴶传》。沈的做法也得到了南京秀才们的支持，他们联名上书请求清理天主教。皇帝并没有答复沈㴶的第一封信，于是过了三个月，他又二次上书，除了普通的对传教士传教行为的控告之外，沈㴶还特别提到传教士有意冲掉明太祖陵的龙脉，并提醒皇帝，天主教徒有可能不会对皇帝忠诚。这一次，他还拉上南京礼部尚书，后者也给皇帝写了奏疏。
在礼部尚书的奏疏出现在邸报上之后，徐光启立刻写了一封反驳的奏疏，其中提道：请皇帝研究传教士的书，看有没有谋反的成分；请佛道之徒与传教士辩论，看谁能获胜；让传教士说出他们的教义，看是否大逆不道。