除了奴隶之外，荷兰人依靠的另一大群体就是华人。到1619年末，已经有四百多名华人迁到巴达维亚。1632年，巴达维亚共有二千三百九十名华人，他们主要从事建筑行业，建造了百分之四十五的当地建筑。荷兰对华人的管理既给予自由，也有防范。1619年，他们任命苏鸣岗担任华人首领，这个华人首领职位后来就成了甲必丹。甲必丹最初掌控对华进出口贸易，从1620年起开始管理城市的称量房。另一位叫杨昆的华人则垄断赌博业并发了大财。见《东南亚史：危险而关键的十字路口》。但荷兰人又有对华人防范的一面，万丹曾经使用武力阻止中国帆船前来贸易，并不惜抢劫华人的船只，杀害华商。巴达维亚也曾经发生过集体抢劫和屠杀华人的事件
