方从哲的倒台也导致了其亲信沈㴶的致仕。天启元年（1621）方从哲的离职，更缓和了对传教士的迫害。但沈㴶还有一次回光返照的机会。在万历晚期，方从哲曾经想提拔他去往北京，这件事本来已经定下了，但随着两位皇帝的离世，沈㴶新的任命书在他离职之后才到达。接到任命书的他还是去了北京，并借助天启二年山东白莲教起事，将天主教诬陷为白莲教同伙，再次对其加害。
从此之后，谢务禄改名为曾德昭，王丰肃改名为高一志。熊三拔和庞迪我没有返回，不久都死于澳门。
只是这一次时间并不长久。天启二年（1622）9月15日，沈㴶再次被罢。他离开后，迫害天主教的主要力量暂时削弱。皇帝禁止传教的命令并没有取消，但也没人执行，甚至被贬往澳门的谢务禄和王丰肃也都偷偷返回内地。从此之后，谢务禄改名为曾德昭，王丰肃改名为高一志。熊三拔和庞迪我没有返回，不久都死于澳门。天主教徒经历的第一次教难就这样基本结束了。