南昌的驱逐行动到万历四十五年（1617）才达到顶峰，这一年，三百名秀才联名驱逐传教士。
黄明沙事件虽然告终，但事件的主角付出了生命的代价，这本来是一个警钟，告诉在中国传教的外国人要尊重中国的民间习俗。但双方的冲突一开，情况就很难在短时间内改变。随着传教士铺开到全国，各地都出现了规模不等的抗教事件。比如在利玛窦的下一个据点南昌，也发生过儒生联名请求驱逐传教士的情况。南昌的驱逐行动到万历四十五年（1617）才达到顶峰，这一年，三百名秀才联名驱逐传教士。
万历四十三年（1615），沈㴶上任南京礼部侍郎，于是轮到传教士最发达的据点——杭州和南京出事了。
杭州据点之所以发达，在于杭州有两个著名的人物李之藻和杨廷筠，他们帮助传教士在杭州站稳脚跟，并发展了数百名信徒。而在南京主持工作的传教士王丰肃是一位兢兢业业且精力充沛的人，他不仅发展了从贩夫走卒到高层官员的大批信徒，还修建了明朝最宏伟的大教堂，招致大量的妒忌。